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五年的西医教育，让陈可冀成为福建医学院附属医院的住院大夫。本来为了能离家近点，而选择在福建学医的他仅仅在家乡工作了两年。便响应号召北上首都求学。求学的内容则是与自己之前的专业知识完全不同的中医诊疗体系。
对中医毫不了解的陈可冀服从了组织的分配。幸运的是教授陈可冀中医知识的，是当时两位赫赫有名的中医泰斗。“两位教授就是有‘南冉北张’称号的，冉雪峰和张锡纯。跟他们学习让我了解到，第一，中医药里的几部经典著作要很好的掌握，包括《黄帝内经》、《伤寒论》、《金匮要略》、《神农本草经》等这是最基本的。第二个就是临床经验。那时我每天跟着调方子，那里也有很多苏联专家，所以对我帮助很大。”
刚刚接触中医诊疗方式的陈可冀，并没有因为是跟随中医大师学习而完全抛弃之前所学到的西医理论。
在大量的实践中，陈可冀逐渐发现，西医的检查方式，能在很大程度上弥补中医临床诊疗理论上的不足。“我们国家政策就是中西医并重，重建中西医结合，实现中医药现代化。比如脑血管病，没有做CT、 MRI，就不知道是不是脑出血？出血量多少？是不是脑梗塞？是不是脑血管畸形？等等。所以需要现代医学的诊断。又比如说肿瘤，西医对中晚期的肿瘤就没有什么好办法，它要杀肿瘤，病人的正常器官也会受伤害，生活质量就更差了。这个时候如果用中医的办法治疗，虽然不能根治，但还是可以在一定程度上延长病人的寿命。所以治疗不同的病，可以选择不同的方法。”
